ENSDARG00000102220


Danio rerio

Features
Gene ID: ENSDARG00000102220
  
Biological name :RF00026
  
Synonyms : RF00026
  
Possible biological names infered from orthology : Gm22165 / Gm22359 / Gm22708 / Gm22974 / Gm23055 / Gm23066 / Gm23093 / Gm23856 / Gm24226 / Gm24399 / Gm24522 / Gm25008 / Gm25964 / predicted gene, 22165 / predicted gene, 22359 / predicted gene, 22708 / predicted gene, 22974 / predicted gene, 23055 / predicted gene, 23066 / predicted gene, 23093 / predicted gene, 23856 / predicted gene, 24226 / predicted gene, 24399 / predicted gene, 24522 / predicted gene, 25008 / predicted gene, 25964 / RNA, U6 small nuclear 1087, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 1121, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 1137, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 1242, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 164, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 192, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 237, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 256, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 299, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 436, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 462, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 72, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 925, pseudogene / RNU6-1087P / RNU6-1121P / RNU6-1137P / RNU6-1242P / RNU6-164P / RNU6-172P / RNU6-192P / RNU6-237P / RNU6-256P / RNU6-299P / RNU6-436P / RNU6-462P / RNU6-641P / RNU6-677P / RNU6-72P / RNU6-925P
  
Species: Danio rerio
  
Chr. number: 4
Strand: -1
Band:
Gene start: 42466419
Gene end: 42466521
  
Corresponding Affymetrix probe sets:
  
Cross references: Ensembl - ENSDARG00000102220
  
See co-cited genes in PubMed


Ortholog prediction (from Ensembl)
Ortholog nameID Species
 RF00026ENSGALG00000017904Gallus gallus
 RNU6-1087PENSG00000252411Homo sapiens
 RNU6-1121PENSG00000252611Homo sapiens
 RNU6-1137PENSG00000252882Homo sapiens
 RNU6-1242PENSG00000212354Homo sapiens
 RNU6-164PENSG00000201474Homo sapiens
 RNU6-172PENSG00000222932Homo sapiens
 RNU6-192PENSG00000212555Homo sapiens
 RNU6-237PENSG00000251794Homo sapiens
 RNU6-256PENSG00000252556Homo sapiens
 RNU6-299PENSG00000253032Homo sapiens
 RNU6-436PENSG00000251980Homo sapiens
 RNU6-462PENSG00000199529Homo sapiens
 RNU6-641PENSG00000206733Homo sapiens
 RNU6-677PENSG00000252723Homo sapiens
 RNU6-72PENSG00000207012Homo sapiens
 RNU6-925PENSG00000207359Homo sapiens
 Gm22165ENSMUSG00000089039Mus musculus
 Gm22359ENSMUSG00000064818Mus musculus
 Gm22708ENSMUSG00000089612Mus musculus
 Gm22974ENSMUSG00000065235Mus musculus
 Gm23055ENSMUSG00000064739Mus musculus
 Gm23066ENSMUSG00000088862Mus musculus
 Gm23093ENSMUSG00000065384Mus musculus
 Gm23856ENSMUSG00000089005Mus musculus
 Gm24226ENSMUSG00000089451Mus musculus
 Gm24399ENSMUSG00000088494Mus musculus
 Gm24522ENSMUSG00000065898Mus musculus
 Gm25008ENSMUSG00000065743Mus musculus
 Gm25964ENSMUSG00000087796Mus musculus


Paralog prediction (from Ensembl)
Paralog nameIDSimilarity(%)
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000011647492
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000011010192
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000011095691
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000011253691
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000011568691
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000011091691
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000011639691
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000011305191
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000010007991
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000011718391
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000010456590
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000011386190
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000011142190
RF00026 / RNU6-72P* / RNU6-925P* / RNU6-164P* / RNU6-172P* / RNU6-192P* / RNU6-237P* / RNU6-256P* / RNU6-299P* / RNU6-436P* / RNU6-462P* / RNU6-641P* / RNU6-677P* / RNU6-1121P* / RNU6-1137P...ENSDARG0000010375390
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011133083
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011081383
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011333783
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011665283
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011405882
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011166382


Protein motifs (from Interpro)
Interpro ID Name
No match


Gene Ontology (GO)
TypeGO IDTermEv.Code
No match


Pathways (from Reactome)
Pathway description
No match


Phenotype (from MGI, Zfin or HPO)
IDPhenotypeDefinition Genetic BG
No match
  


Interacting proteins (from Reactome)
Interactor ID Name Interaction type
No match






 

1 s.

 
External programs and data are copyrighted by and are the property of their respective authors.
The Manteia system, data and analyses are provided "as is" with no warranties, expressed or implied as to capabilities or accuracy. User assumes the entire risk as to the results and performance of the software, data and documentation


                   

© Olivier Tassy / Olivier Pourquie 2007-2024
contact: otassy@igbmc.fr