ENSDARG00000082380


Danio rerio

Features
Gene ID: ENSDARG00000082380
  
Biological name :RF00026
  
Synonyms : RF00026
  
Possible biological names infered from orthology : Gm22845 / Gm23242 / Gm23516 / Gm24527 / Gm25142 / Gm25205 / Gm25713 / predicted gene, 22845 / predicted gene, 23242 / predicted gene, 23516 / predicted gene, 24527 / predicted gene, 25142 / predicted gene, 25205 / predicted gene, 25713 / RNA, U6 small nuclear 1025, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 1035, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 1159, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 115, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 1204, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 1231, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 1281, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 204, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 208, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 250, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 268, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 484, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 626, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 695, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 710, pseudogene / RNA, U6 small nuclear 812, pseudogene / RNU6-1025P / RNU6-1035P / RNU6-1159P / RNU6-115P / RNU6-1204P / RNU6-1231P / RNU6-1281P / RNU6-204P / RNU6-208P / RNU6-250P / RNU6-268P / RNU6-484P / RNU6-626P / RNU6-695P / RNU6-710P / RNU6-812P
  
Species: Danio rerio
  
Chr. number: 16
Strand: -1
Band:
Gene start: 46216808
Gene end: 46216909
  
Corresponding Affymetrix probe sets:
  
Cross references: Ensembl - ENSDARG00000082380
  
See co-cited genes in PubMed


Ortholog prediction (from Ensembl)
Ortholog nameID Species
 RF00026ENSGALG00000017896Gallus gallus
 RF00026ENSG00000283313Homo sapiens
 RNU6-1025PENSG00000222561Homo sapiens
 RNU6-1035PENSG00000207206Homo sapiens
 RNU6-1159PENSG00000199803Homo sapiens
 RNU6-115PENSG00000201180Homo sapiens
 RNU6-1204PENSG00000200818Homo sapiens
 RNU6-1231PENSG00000252994Homo sapiens
 RNU6-1281PENSG00000252032Homo sapiens
 RNU6-204PENSG00000199335Homo sapiens
 RNU6-208PENSG00000199301Homo sapiens
 RNU6-250PENSG00000252767Homo sapiens
 RNU6-268PENSG00000201044Homo sapiens
 RNU6-484PENSG00000206743Homo sapiens
 RNU6-626PENSG00000200224Homo sapiens
 RNU6-695PENSG00000212459Homo sapiens
 RNU6-710PENSG00000222356Homo sapiens
 RNU6-812PENSG00000200048Homo sapiens
 Gm22845ENSMUSG00000088337Mus musculus
 Gm23242ENSMUSG00000094312Mus musculus
 Gm23516ENSMUSG00000070240Mus musculus
 Gm24527ENSMUSG00000064854Mus musculus
 Gm25142ENSMUSG00000064632Mus musculus
 Gm25205ENSMUSG00000064775Mus musculus
 Gm25713ENSMUSG00000089250Mus musculus


Paralog prediction (from Ensembl)
Paralog nameIDSimilarity(%)
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011591785
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000010197184
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000010422684
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000010922184
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011132484
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011167984
RF00026 / Gm22716* / Gm22886* / Gm24393* / Gm24457* / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1072P* / RNU6-1323P* / RNU6-1251P* / RNU6-1099P* / RNU6-1079P* / predicted gene, 22886* / p...ENSDARG0000011454584
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011454884
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011477284
RF00026 / Gm22716* / Gm22886* / Gm24393* / Gm24457* / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1072P* / RNU6-1323P* / RNU6-1251P* / RNU6-1099P* / RNU6-1079P* / predicted gene, 22886* / p...ENSDARG0000011513484
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011525884
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011537984
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011601084
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000011606184
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000009842983
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000010921383
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000010945783
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000010986083
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000010991783
RF00026 / RNU6-790P* / RNU6-225P* / RNU6-771P* / RNU6-1251P* / RNU6-1323P* / RNU6-1072P* / RNU6-1079P* / RNU6-1099P* / RNA, U6 small nuclear 225, pseudogene* / RNA, U6 small nuclear 771, ps...ENSDARG0000010995183


Protein motifs (from Interpro)
Interpro ID Name
No match


Gene Ontology (GO)
TypeGO IDTermEv.Code
No match


Pathways (from Reactome)
Pathway description
No match


Phenotype (from MGI, Zfin or HPO)
IDPhenotypeDefinition Genetic BG
No match
  


Interacting proteins (from Reactome)
Interactor ID Name Interaction type
No match