ENSMUSG00000096677


Mus musculus

Features
Gene ID: ENSMUSG00000096677
  
Biological name :Gm24518
  
Synonyms : Gm24518 / predicted gene, 24518
  
Possible biological names infered from orthology : RF00108 / small nucleolar RNA, C/D box 116-1 / small nucleolar RNA, C/D box 116-2 / small nucleolar RNA, C/D box 116-3 / small nucleolar RNA, C/D box 116-4 / small nucleolar RNA, C/D box 116-5 / small nucleolar RNA, C/D box 116-6 / small nucleolar RNA, C/D box 116-7 / small nucleolar RNA, C/D box 116-8 / small nucleolar RNA, C/D box 116-9 / SNORD116-1 / SNORD116-2 / SNORD116-3 / SNORD116-4 / SNORD116-5 / SNORD116-6 / SNORD116-7 / SNORD116-8 / SNORD116-9
  
Species: Mus musculus
  
Chr. number: 7
Strand: -1
Band: B5
Gene start: 59728681
Gene end: 59728774
  
Corresponding Affymetrix probe sets:
  
Cross references: MGI - MGI:5454295
Ensembl - ENSMUSG00000096677
  
See co-cited genes in PubMed


Ortholog prediction (from Ensembl)
Ortholog nameID Species
 RF00108ENSG00000212553Homo sapiens
 SNORD116-1ENSG00000207063Homo sapiens
 SNORD116-2ENSG00000207001Homo sapiens
 SNORD116-3ENSG00000207014Homo sapiens
 SNORD116-4ENSG00000275529Homo sapiens
 SNORD116-5ENSG00000207191Homo sapiens
 SNORD116-6ENSG00000207442Homo sapiens
 SNORD116-7ENSG00000207133Homo sapiens
 SNORD116-8ENSG00000207093Homo sapiens
 SNORD116-9ENSG00000206727Homo sapiens


Paralog prediction (from Ensembl)
Paralog nameIDSimilarity(%)
Gm25074 / predicted gene, 25074 / RF00108* / SNORD116-9* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / small nucleolar RN...ENSMUSG0000009547999
Gm22631 / predicted gene, 22631 / RF00108* / SNORD116-9* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / small nucleolar RN...ENSMUSG0000009386998
Snord116l4 / small nucleolar RNA, C/D box 116-like 4 / RF00108* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / SNORD116-9*...ENSMUSG0000009397198
Snord116l17 / small nucleolar RNA, C/D box 116-like 17 / RF00108* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / SNORD116-...ENSMUSG0000009397498
Snord116l5 / small nucleolar RNA, C/D box 116-like 5 / RF00108* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / SNORD116-9*...ENSMUSG0000009403998
Gm25155 / predicted gene, 25155 / RF00108* / SNORD116-9* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / small nucleolar RN...ENSMUSG0000009406998
Gm23265 / predicted gene, 23265 / RF00108* / SNORD116-9* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / small nucleolar RN...ENSMUSG0000009415098
Gm24609 / predicted gene, 24609 / RF00108* / SNORD116-9* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / small nucleolar RN...ENSMUSG0000009423698
Gm26433 / predicted gene, 26433 / RF00108* / SNORD116-9* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / small nucleolar RN...ENSMUSG0000009428798
Snord116l13 / small nucleolar RNA, C/D box 116-like 13 / RF00108* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / SNORD116-...ENSMUSG0000009457398
Snord116l3 / small nucleolar RNA, C/D box 116-like 3 / RF00108* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / SNORD116-9*...ENSMUSG0000009459998
Snord116l10 / small nucleolar RNA, C/D box 116-like 10 / RF00108* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / SNORD116-...ENSMUSG0000009464298
Gm22285 / predicted gene, 22285 / RF00108* / SNORD116-9* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / small nucleolar RN...ENSMUSG0000009489098
Gm24760 / predicted gene, 24760 / RF00108* / SNORD116-9* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / small nucleolar RN...ENSMUSG0000009492398
Gm22417 / predicted gene, 22417 / RF00108* / SNORD116-9* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / small nucleolar RN...ENSMUSG0000009496098
Snord116l15 / small nucleolar RNA, C/D box 116-like 15 / RF00108* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / SNORD116-...ENSMUSG0000009498798
Gm22128 / predicted gene, 22128 / RF00108* / SNORD116-9* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / small nucleolar RN...ENSMUSG0000009510098
Snord116l16 / small nucleolar RNA, C/D box 116-like 16 / RF00108* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / SNORD116-...ENSMUSG0000009537498
Snord116l8 / small nucleolar RNA, C/D box 116-like 8 / RF00108* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / SNORD116-9*...ENSMUSG0000009545898
Gm26246 / predicted gene, 26246 / RF00108* / SNORD116-9* / SNORD116-1* / SNORD116-2* / SNORD116-3* / SNORD116-4* / SNORD116-5* / SNORD116-6* / SNORD116-7* / SNORD116-8* / small nucleolar RN...ENSMUSG0000009561898


Protein motifs (from Interpro)
Interpro ID Name
No match


Gene Ontology (GO)
TypeGO IDTermEv.Code
No match


Pathways (from Reactome)
Pathway description
No match


Phenotype (from MGI, Zfin or HPO)
IDPhenotypeDefinition Genetic BG
No match
  


Interacting proteins (from Reactome)
Interactor ID Name Interaction type
No match